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Spark UnifiedMemoryManager内存管理模型分析
 
来源:简书 发布于:2017-7-28
  1828  次浏览      50
 

Spark的内存使用,大体上可以分为两类:Execution内存和Storage内存。在Spark 1.5版本之前,内存管理使用的是StaticMemoryManager,该内存管理模型最大的特点就是,可以为Execution内存区与Storage内存区配置一个静态的boundary,这种方式实现起来比较简单,但是存在一些问题:

  1. 没有一个合理的默认值能够适应不同计算场景下的Workload
  2. 内存调优困难,需要对Spark内部原理非常熟悉才能做好
  3. 对不需要Cache的Application的计算场景,只能使用很少一部分内存

为了克服上述提到的问题,尽量提高Spark计算的通用性,降低内存调优难度,减少OOM导致的失败问题,从Spark 1.6版本开始,新增了UnifiedMemoryManager(统一内存管理)内存管理模型的实现。UnifiedMemoryManager依赖的一些组件类及其关系,如下类图所示:

从上图可以看出,最直接最核心的就是StorageMemoryPool 和ExecutionMemoryPool,它们实现了动态内存池(Memory Pool)的功能,能够动态调整Storage内存区与Execution内存区之间的Soft boundary,使内存管理更加灵活。下面我们从内存布局和内存控制两个方面,来分析UnifiedMemoryManager内存管理模型。

内存布局

UnifiedMemoryManager是MemoryManager的一种实现,是基于StaticMemoryManager的改进。这种模型也是将某个执行Task的Executor JVM内存划分为两类内存区域:

  • Storage内存区
    Storage内存,用来缓存Task数据、在Spark集群中传输(Propagation)内部数据。
  • Execution内存区
    Execution内存,用于满足Shuffle、Join、Sort、Aggregation计算过程中对内存的需求。

这种新的内存管理模型,在Storage内存区与Execution内存区之间抽象出一个Soft boundary,能够满足当某一个内存区中内存用量不足的时候,可以从另一个内存区中借用。我们可以理解为,上面Storage内存和Execution堆内存是受Spark管理的,而且每一个内存区是可以动态伸缩的。这样的好处是,当某一个内存区内存使用量达到初始分配值,如果不能够动态伸缩,不能在两类内存区之间进行动态调整(Borrow),或者如果某个Task计算的数据量很大超过限制,就会出现OOM异常导致Task执行失败。应该说,在一定程度上,UnifiedMemoryManager内存管理模型降低了发生OOM的概率。

我们知道,在Spark Application提交以后,最终会在Worker上启动独立的Executor JVM,Task就运行在Executor里面。在一个Executor JVM内部,基于UnifiedMemoryManager这种内存管理模型,堆内存的布局如下图所示:

上图中,systemMemory是Executor JVM的全部堆内存,在全部堆内存基础上reservedMemory是预留内存,默认300M,则用于Spark计算使用堆内存大小默认是:

maxHeapMemory = (systemMemory - reservedMemory) * 0.6

受Spark管理的堆内存,使用去除预留内存后的、剩余内存的百分比,可以通过参数spark.memory.fraction来配置,默认值是0.6。Executor JVM堆内存,去除预留的reservedMemory内存,默认剩下堆内存的60%用于execution和storage这两类堆内存,默认情况下,Execution和Storage内存区各占50%,这个也可以通过参数spark.memory.storageFraction来配置,默认值是0.5。比如,在所有参数使用默认值的情况下,我们的Executor JVM内存为指定为2G,那么Unified Memory大小为(1024 * 2 – 300) * 0.6 = 1048MB,其中,Execution和Storage内存区大小分别为1048 * 0.5 = 524MB。

另外,还有一个用来保证Spark Application能够计算的最小Executor JVM内存大小限制,即为minSystemMemory = reservedMemory * 1.5 = 300 * 1.5 = 450MB,我们假设Executor JVM配置了这个默认最小限制值450MB,则受Spark管理的堆内存大小为(450 – 300) * 0.6 = 90MB,其中Execution和Storage内存大小分别为90 * 0.5 = 45MB,这种情况对一些小内存用量的Spark计算也能够很好的支持。

上面,我们详细说明了受Spark管理的堆内存(OnHeap Memory)的布局,UnifiedMemoryManager也能够对非堆内存(OffHeap Memory)进行管理。Spark堆内存和非堆内存的布局,如下图所示:

通过上图可以看到,非堆内存(OffHeap Memory)默认大小配置值为0,表示不使用非堆内存,可以通过参数spark.memory.offHeap.size来设置非堆内存的大小。无论是对堆内存,还是对非堆内存,都分为Execution内存和Storage内存两部分,他们的分配大小比例通过参数spark.memory.storageFraction来控制,默认是0.5。

内存控制

通过上面,我们了解了UnifiedMemoryManager这种内存管理模型的内存布局状况。接下来,我们看一下,通过UnifiedMemoryManager的API,如何对内存进行控制(分配/回收)。内存的控制,也对应于Execution内存与Storage内存,分别有一个StorageMemoryPool 和ExecutionMemoryPool,在实现类UnifiedMemoryManager中可以看到通过这两个MemoryPool实现来控制内存大小的伸缩(Increment/Decrement)。

获取当前堆上的最大可用Storage内存,如下maxOnHeapStorageMemory方法所示:

override def maxOnHeapStorageMemory: Long = synchronized {
maxHeapMemory - onHeapExecutionMemoryPool.memoryUsed
}

可以看到,maxHeapMemory表示堆上可用的Execution内存与Storage内存总量之和,减去Execution内存中已经被占用的内存,剩余的都是堆上的最大可用Storage内存。

在UnifiedMemoryManager中,两类最核心的操作,就是申请/释放Storage内存、申请/释放Execution内存,分别说明如下:

申请Storage内存

申请Storage内存的逻辑,实现代码如下所示:

override def acquireStorageMemory(
blockId: BlockId,
numBytes: Long,
memoryMode: MemoryMode): Boolean = synchronized { // 为blockId申请numBytes字节大小的内存
assertInvariants()
assert(numBytes >= 0)
val (executionPool, storagePool, maxMemory) = memoryMode match { // 根据memoryMode值,返回对应的StorageMemoryPool与ExecutionMemoryPool
case MemoryMode.ON_HEAP => (
onHeapExecutionMemoryPool,
onHeapStorageMemoryPool,
maxOnHeapStorageMemory)
case MemoryMode.OFF_HEAP => (
offHeapExecutionMemoryPool,
offHeapStorageMemoryPool,
maxOffHeapMemory)
}
if (numBytes > maxMemory) { // 如果申请的内存大于最大的Storage内存量(对应上面方法maxOnHeapStorageMemory()返回的内存大小),申请失败
// Fail fast if the block simply won't fit
logInfo(s"Will not store $blockId as the required space ($numBytes bytes) exceeds our " +
s"memory limit ($maxMemory bytes)")
return false
}
if (numBytes > storagePool.memoryFree) { // 如果Storage内存块中没有足够可用内存给blockId使用,则计算当前Storage内存区缺少多少内存,然后从Execution内存区中借用
// There is not enough free memory in the storage pool, so try to borrow free memory from
// the execution pool.
val memoryBorrowedFromExecution = Math.min(executionPool.memoryFree, numBytes)
executionPool.decrementPoolSize(memoryBorrowedFromExecution) // Execution内存区减掉借用内存量
storagePool.incrementPoolSize(memoryBorrowedFromExecution) // Storage内存区增加借用内存量
}
storagePool.acquireMemory(blockId, numBytes) // 如果Storage内存区可以为blockId分配内存,直接成功分配;否则,如果从Execution内存区中借用的内存能够满足blockId,则分配成功,不能满足则分配失败。
}

如果Storage内存区可用内存满足申请大小,则直接成功分配内存;如果Storage内存区可用内存大于0且小于申请的内存大小,则需要从Execution内存区借用满足分配大小的内存,如果借用成功,则直接成功分配内存,否则分配失败;如果申请的内存超过了Storage内存区的最大内存量,则分配失败。

另外,UnifiedMemoryManager.acquireUnrollMemory()方法提供了对Unroll内存的申请,Unroll内存就是Storage内存:

override def acquireUnrollMemory(
blockId: BlockId,
numBytes: Long,
memoryMode: MemoryMode): Boolean = synchronized {
acquireStorageMemory(blockId, numBytes, memoryMode)
}

Unroll内存 ,被用来在Storage内存中Unroll(展开)指定的Block数据。

释放Storage内存

释放Storage内存比较简单,只需要更新Storage内存计量变量即可,如下所示:

def releaseMemory(size: Long): Unit = lock.synchronized {
if (size > _memoryUsed) {
logWarning(s"Attempted to release $size bytes of storage " +
s"memory when we only have ${_memoryUsed} bytes")
_memoryUsed = 0
} else {
_memoryUsed -= size
}
}

申请Execution内存

申请Execution内存,相对复杂一些,调用acquireExecutionMemory()方法可能会阻塞,直到Execution内存区有可用内存为止。UnifiedMemoryManager的acquireExecutionMemory()方法实现如下所示:

override private[memory] def acquireExecutionMemory(
numBytes: Long,
taskAttemptId: Long,
memoryMode: MemoryMode): Long = synchronized {
... ...
executionPool.acquireMemory(
numBytes, taskAttemptId, maybeGrowExecutionPool, computeMaxExecutionPoolSize)
}

上面代码,调用了ExecutionMemoryPool的acquireMemory()方法,该方法的参数需要2个函数(maybeGrowExecutionPool函数用来控制如何增加Execution内存区对应Pool的大小,computeMaxExecutionPoolSize函数用来获取当前Execution内存区对应Pool的大小)。ExecutionMemoryPool的acquireMemory()方法签名,如下所示:

private[memory] def acquireMemory(
numBytes: Long,
taskAttemptId: Long,
maybeGrowPool: Long => Unit = (additionalSpaceNeeded: Long) => Unit,
computeMaxPoolSize: () => Long = () => poolSize): Long = lock.synchronized {

在UnifiedMemoryManager内部,实现了如何动态增加Execution内存区对应Pool大小的函数,即为maybeGrowExecutionPool函数,代码如下所示:

def maybeGrowExecutionPool(extraMemoryNeeded: Long): Unit = {
if (extraMemoryNeeded > 0) {
// There is not enough free memory in the execution pool, so try to reclaim memory from
// storage. We can reclaim any free memory from the storage pool. If the storage pool
// has grown to become larger than `storageRegionSize`, we can evict blocks and reclaim
// the memory that storage has borrowed from execution.
val memoryReclaimableFromStorage = math.max( storagePool.memoryFree, storagePool.poolSize - storageRegionSize)
if (memoryReclaimableFromStorage > 0) { // 这里memoryReclaimableFromStorage大于0,说明当前Storage内存区有可用内存,可以Shrink该Pool的内存,作为Execution内存区的可用内存使用
// Only reclaim as much space as is necessary and available:
val spaceToReclaim = storagePool.freeSpaceToShrinkPool( math.min(extraMemoryNeeded, memoryReclaimableFromStorage)) // 对Storage内存区进行Shrink操作,如果可用内存大于请求内存extraMemoryNeeded,则直接将Storage内存区内存Shrink大小为extraMemoryNeeded,否则Shrink大小为Storage内存区的全部可用内存大小
storagePool.decrementPoolSize(spaceToReclaim) // Storage内存区减掉借用内存量
executionPool.incrementPoolSize(spaceToReclaim) // Execution内存区增加借用内存量
}
}
}

需要说明的是,上面的storagePool.poolSize的大小可能大于Storage内存区初始最大内存大小,主要是通过借用Execution内存区的内存导致的。这里,storagePool.freeSpaceToShrinkPool()方法会Shrink掉Storage内存区可用内存,我们可以看下StorageMemoryPool中如何Shrink Storage内存,方法如下所示:

def freeSpaceToShrinkPool(spaceToFree: Long): Long = lock.synchronized {
val spaceFreedByReleasingUnusedMemory = math.min(spaceToFree, memoryFree)
val remainingSpaceToFree = spaceToFree - spaceFreedByReleasingUnusedMemory // Storage内存区需要释放remainingSpaceToFree大小的内存
if (remainingSpaceToFree > 0) { // 大于0表示当前Storage内存区已经无可用内存,需要通过清理Storage内存区的block来实现Shrink操作
// If reclaiming free memory did not adequately shrink the pool, begin evicting blocks:
val spaceFreedByEviction = memoryStore.evictBlocksToFreeSpace(None, remainingSpaceToFree, memoryMode) // 通过清理Storage内存区的block释放的内存大小
// When a block is released, BlockManager.dropFromMemory() calls releaseMemory(), so we do
// not need to decrement _memoryUsed here. However, we do need to decrement the pool size.
spaceFreedByReleasingUnusedMemory + spaceFreedByEviction
} else { // remainingSpaceToFree<=0说明当前Storage内存区可用内存足够,不需要通过清理缓存的Block来释放内存
spaceFreedByReleasingUnusedMemory
}
}

MemoryStore如何evictBlocksToFreeSpace,可以查阅MemoryStore类源码,这里暂时不做说明。

最后,我们说明ExecutionMemoryPool.acquireMemory()方法与ExecutionMemoryPool.releaseMemory()方法的实现。在说明方法实现逻辑之前,我们先说明一下Execution内存区内存分配的基本原则:

如果有N个活跃(Active)的Task在运行,ExecutionMemoryPool需要保证每个Task在将中间结果数据Spill到磁盘之前,至少能够申请到当前Execution内存区对应的Pool中1/2N大小的内存量,至多是1/N大小的内存。这里N是动态变化的,因为可能有新的Task被启动,也有可能Task运行完成释放资源,所以ExecutionMemoryPool会持续跟踪ExecutionMemoryPool内部Task集合memoryForTask的变化,并不断地重新计算分配给每个Task的这两个内存量的值:1/2N和1/N。

为了代码紧凑清晰,我把ExecutionMemoryPool.acquireMemory()方法源码中不必要的注释去掉了,代码如下所示:

private[memory] def acquireMemory(
numBytes: Long,
taskAttemptId: Long,
maybeGrowPool: Long => Unit = (additionalSpaceNeeded: Long) => Unit,
computeMaxPoolSize: () => Long = () => poolSize): Long = lock.synchronized {
assert(numBytes > 0, s"invalid number of bytes requested: $numBytes")
if (!memoryForTask.contains(taskAttemptId)) { // ExecutionMemoryPool内部维护了一个HashMap<TaskAttempID, 内存占用字节数>
memoryForTask(taskAttemptId) = 0L
// This will later cause waiting tasks to wake up and check numTasks again
lock.notifyAll()
}
while (true) {
val numActiveTasks = memoryForTask.keys.size // 当前活跃的Task数量
val curMem = memoryForTask(taskAttemptId) // 当前Task使用的内存量
maybeGrowPool(numBytes - memoryFree) // 如果需要,通过Shrink Storage内存区对应的Pool内存来增加Execution内存区内存大小
val maxPoolSize = computeMaxPoolSize() // 计算当前Execution内存区对应Pool的大小
val maxMemoryPerTask = maxPoolSize / numActiveTasks // 计算1/N:将当前Execution内存区对应Pool的大小,平均分配给所有活跃的Task,得到每个Task能够获取到的最大内存大小
val minMemoryPerTask = poolSize / (2 * numActiveTasks) // 计算1/2N:每个Task能够获取到的最小内存大小
val maxToGrant = math.min(numBytes, math.max(0, maxMemoryPerTask - curMem)) // 允许当前Task获取到最大内存(范围:0 <= X <= 1 / numActiveTasks )
val toGrant = math.min(maxToGrant, memoryFree) // 计算能分配给当前Task的内存大小
// 如果当前Task无法获取到1 / (2 * numActiveTasks)的内存,并且能分配给当前Task的内存大小无法满足申请的内存量,则阻塞等待其他Task释放内存后在lock上通知
if (toGrant < numBytes && curMem + toGrant < minMemoryPerTask) {
logInfo(s"TID $taskAttemptId waiting for at least 1/2N of $poolName pool to be free")
lock.wait() // 在ExecutionMemoryPool.releaseMemory()方法中会通知其他申请内存并在lock上wait的Task,内存已经释放
} else {
memoryForTask(taskAttemptId) += toGrant // 当前Task获取到内存,需要登记到memoryForTask表中
return toGrant
}
}
0L // Never reached
}

释放Execution内存

相对应的,ExecutionMemoryPool.releaseMemory()方法实现了对Execution内存的释放操作,方法实现代码如下所示:

def releaseMemory(numBytes: Long, taskAttemptId: Long): Unit = lock.synchronized {
val curMem = memoryForTask.getOrElse(taskAttemptId, 0L)
var memoryToFree = if (curMem < numBytes) { // 计算释放内存大小
logWarning( s"Internal error: release called on $numBytes bytes but task only has $curMem bytes " +
s"of memory from the $poolName pool")
curMem
} else {
numBytes
}
if (memoryForTask.contains(taskAttemptId)) { // Task执行完成,从内部维护的memoryForTask中移除
memoryForTask(taskAttemptId) -= memoryToFree
if (memoryForTask(taskAttemptId) <= 0) {
memoryForTask.remove(taskAttemptId)
}
}
lock.notifyAll() // 通知调用acquireMemory()方法申请内存的Task内存已经释放
}

总结

需要注意的,每个Executor JVM中只存在一个UnifiedMemoryManager实例,该对象统一控制该JVM内对Storage和Execution内存的申请和释放操作。

通过上面的分析,UnifiedMemoryManager可以看做一个统一的内存管理控制器,底层通过StorageMemoryPool 与ExecutionMemoryPool提供的申请内存、释放内存的功能,实现最基本的bookkeeping功能。再向底层,实际操作Block及其Java对象等数据的功能,都是在MemoryStore中进行的,MemoryStore被用来在内存中存储数据,主要包括block、反序列化的Java对象数组、序列化的ByteBuffer,同时它提供了存取内存中各种格式数据的操作。关于MemoryStore的基本结构和原理,我们后续会单独分析。

   
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