准确地讲清楚打标签与添加、删除文件之间的相互关系不那么容易；其他部分的cvs对于跟踪文件存在与否都处理的不错。默认作法是，打标签只对有版本的文件进行。文件如果不存在或者被删除了将被忽略，cvs对没有标签的文件认为它在打标签时不存在。
但这种作法会丢失一些信息。例如，假设有一个文件被添加，然后又给删除了。那么对于没有标签的文件，cvs没法知道打标签是在添加前还是在删除后执行的。如果是用cvs rtag加-r选项，cvs对已删除的文件也能打标签，这样就避免了上述问题。例如，你可以用-r HEAD来给版本树的头打标签。
为了处理添加、删除的文件，有cvs rtag命令一个-a选项来避免给删除的文件打标签。例如，你可以与移动标签-F选项同时使用。要是没有-a选项而移动标签，标签仍然会指向被删除文件的旧版本，而不能正确反映文件已经被删除。对采用-r选项的操作，上面解释过，不需-a选项。